Ekosystém Zličínského potoka a jeho nivy je vystaven dlouhodobým negativním účinkům v důsledku vypouštění znečištěných odpadních vod specifického charakteru. Hlavním potenciálním zdrojem znečištění Zličínského potoka je provoz chemicko – technologické ČOV společnosti Klio, s.r.o., odkud jsou čištěné odpadní vody vypouštěny do zájmového recipientu. V důsledku dlouhodobých problémů s kvalitou vody Zličínského potoka a přítomnosti polutantů v navazující nivě toku si Magistrát hlavního města Prahy nechal vypracovat hydrobiologický monitoring lokality, jehož výsledky jsou náplní této práce. Cílem biomonitoringu bylo zodpovědět následující základní otázky:

1) Jak se chronické znečištění toku projevuje na vodních společenstvech živočichů vodního toku a v prostoru navazující nivy

2) Co je hlavním zdrojem znečištění Zličínského potoka   

Hydrobiologický monitoring byl realizován v průběhu jednoho celého roku a pokryl všechna čtyři roční období. Monitoring se uskutečnil ve 4 návštěvách – 10.7.2013, 4.9.2013, 14.1.2014 a 2.4.2014. Při každé návštěvě byl procházen úsek Zličínského potoka od Velkého rybníka (ul. Dolňanská, Zličín) po rybník Strnad (Hostivice). Monitorovanými skupinami živočichů byli vodní bezobratlí (zoobentos a zooplankton), ryby a obojživelníci. Doplňkově byla pozornost věnována také dalším skupinám živočichů, vázaným do blízkosti vod. V tekoucích vodách byla pozornost věnována zejména zoobentosu a rybám, ve vodách stojatých (tůně a mokřady v nivě toku, rybníky) pak zoobentosu, zooplanktonu a obojživelníkům.